Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Polr1eQ8K202 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Polr1eQ8K202 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr1eQ8K202 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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