Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sde2Q8K1J5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sde2Q8K1J5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms