Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn3Q8K045 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms