Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Q4Q8HWB2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q4Q8HWB2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q4Q8HWB2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q4Q8HWB2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q4Q8HWB2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Q4Q8HWB2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms