Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI19

Pdgfc, Platelet-derived growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfcQ8CI19 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PdgfcQ8CI19 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfcQ8CI19 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms