Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFH6

Sik2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik2Q8CFH6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sik2Q8CFH6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sik2Q8CFH6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms