Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hpf1Q8CFE2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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