Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Pramef8Q8CE24 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Pramef8Q8CE24 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Pramef8Q8CE24 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef8Q8CE24 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms