Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc17Q8CE13 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms