Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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