Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf170Q8CBG9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms