Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin9Q8C735 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms