Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nlrp4bQ8C6J9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nlrp4bQ8C6J9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Nlrp4bQ8C6J9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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