Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccser1Q8C0C4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccser1Q8C0C4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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