Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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