Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smarcal1Q8BJL0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smarcal1Q8BJL0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smarcal1Q8BJL0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smarcal1Q8BJL0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smarcal1Q8BJL0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smarcal1Q8BJL0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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