Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms