Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Htatsf1Q8BGC0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Htatsf1Q8BGC0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Htatsf1Q8BGC0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Htatsf1Q8BGC0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htatsf1Q8BGC0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms