Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-M10.4Q85ZW8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms