Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmes1Q810Q5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nmes1Q810Q5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Nmes1Q810Q5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nmes1Q810Q5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms