Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ChfrQ810L3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms