Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim19Q80ZU4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms