Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cracr2bQ80ZJ8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms