Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc28Q80XJ3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms