Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Npm2Q80W85 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Npm2Q80W85 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Npm2Q80W85 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms