Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ube2q1Q7TSS2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms