Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccp110Q7TSH4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms