Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms