Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CdsnQ7TPC1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CdsnQ7TPC1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms