Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Scn4bQ7M729 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Scn4bQ7M729 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scn4bQ7M729 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms