Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rtn4rl2Q7M6Z0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rtn4rl2Q7M6Z0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms