Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snd1Q78PY7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms