Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynmQ70IV5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynmQ70IV5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms