Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Topbp1Q6ZQF0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms