Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms