Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Timd4Q6U7R4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Timd4Q6U7R4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms