Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms