Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
BC061212Q6P8K3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
BC061212Q6P8K3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms