Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NipblQ6KCD5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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