Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg9bQ6EBV9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg9bQ6EBV9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg9bQ6EBV9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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