Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms