Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q6DFW0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms