Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc2Q69ZB8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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