Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Irf4Q64287 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms