Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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