Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col4a5Q63ZW6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col4a5Q63ZW6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms