Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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