Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AtmQ62388 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AtmQ62388 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AtmQ62388 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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AtmQ62388 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AtmQ62388 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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