Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfrcQ62351 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms