Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms